Projekt finansowany przez Narodowe Centrum Nauki (OPUS 2020/39/B/NZ3/00018)
Znaczenie autofagii selektywnej i autolizy w procesie floemogenezy: Identyfikacja i charakterystyka jej kluczowych etapów
Kierownik: prof. UAM dr hab. Agnieszka Bagniewska-Zadworna,
Wykonawcy z IBE: dr Karolina Kułak, dr Natalia Wojciechowska, mgr Kornel Michalak
Okres realizacji: 2021-2025
Transport wyprodukowanych w procesie fotosyntezy asymilatów z liści do innych organów roślinnych nie byłby możliwy bez łyka, wchodzącego w skład zespołu tkanek przewodzących roślin naczyniowych. Przepływ asymilatów nie byłby możliwy bez wykształcenia specjalnie do tego celu przystosowanych komórek – rurek sitowych. Najistotniejszym elementem ich budowy jest obecność w poprzecznych ścianach porów, nazywanych płytkami sitowymi. Przez pory przenikają pasma cytoplazmy, co pozwala na transport asymilatów pomiędzy poszczególnymi członami rurek sitowych łyka. Elementy rurek sitowych są ponadto ubogie w organelle komórkowe i w formie dojrzałej pozbawione jądra komórkowego. Mechanizm odpowiedzialny za wybiórczą degradację struktur cytoplazmatycznych podczas rozwoju elementów przewodzących łyka podczas floemogenezy, nie jest jednak znany.
Dążeniem w realizacji projektu jest uzupełnienie braków w dotychczasowej wiedzy na temat mechanizmów kontrolujących floemogenezę u roślin w oparciu o hipotezę, że istnieje unikalny, zaprogramowany genetycznie szlak różnicowania rurek sitowych floemu, który może angażować mechanizmy podobne do programowanej śmierci komórki (PCD) podczas rozwoju drewna w procesie ksylogenezy, które jednak nie będą kończyły się śmiercią komórki sitowej. Co więcej, nie tylko nie odkryto do tej pory mechanizmu, który reguluje proces degradacji struktur cytoplazmatycznych w komórkach łyka, ale także co szczególnie interesujące – nie określono sygnału decydującego o nagłym zaprzestaniu procesów degradacyjnych w momencie dojrzewania komórek przewodzących łyka. W niniejszym projekcie zakładamy, że to autofagia selektywna reguluje proces różnicowania elementów rurek sitowych z tkanki merystematycznej.
Zasadniczym celem realizowanego projektu jest analiza procesu różnicowania się rurek sitowych oraz wytypowanie i porównawcza analiza potencjalnych markerów cytologicznych i molekularnych autofagii w procesie różnicowania elementów przewodzących łyka w korzeniach topoli kalifornijskiej (Populus trichocarpa) oraz rzodkiewnika pospolitego (Arabidopsis thaliana). Spodziewanym efektem końcowym realizacji projektu będzie wyjaśnienie, w jakim stopniu proces floemogenezy jest regulowany genetycznie (podobnie jak genetycznie zaprogramowana śmierć komórki) i w jakiej mierze jest skorelowany z uwarunkowanym przez komórki towarzyszące wspomaganiem przetrwania rurek sitowych z tak ubogim zestawem organelli komórkowych.

Bagniewska-Zadworna A., Wojciechowska N. (2024). Sekwencja nieodwracalnych zdarzeń. Głos Lasu, 01/02: 26-29.
Michalak K. M., Wojciechowska N., Marzec-Schmidt K., & Bagniewska-Zadworna A. (2024). Conserved autophagy and diverse cell wall composition: Unifying features of vascular tissues in evolutionarily distinct plants. Annals of Botany, mcae015, doi: doi.org/10.1093/aob/mcae015.
Kułak K., Wojciechowska N., Samelak-Czajka A., Jackowiak P., & Bagniewska-Zadworna A. (2023). How to explore what is hidden? A review of techniques for vascular tissue expression profile analysis. Plant Methods, 19(1), 129. Doi: 10.1186/s13007-023-01109-8
Opis projektu:
497449-en.pdf (ncn.gov.pl)