Projekt finansowany przez Narodowe Centrum Nauki (2024/53/B/NZ9/03732) 

Modyfikacje RNA w odpowiedzi siewek soi na działanie metali

Kierownik: prof. UAM dr hab. Jagna Chmielowska-Bąk

Wykonawcy z IBE: prof. dr hab. Magdalena Arasimowicz-Jelonek 

Okres realizacji: 2025-2029 

Rośliny są ustawicznie narażone na działanie niekorzystnych warunków środowiska takich jak susza, zbyt wysoka i zbyt niska temperatura, czy też ekspozycja na toksyczne substancje. Dla efektywnej obrony przed czynnikami stresowymi kluczowe są zmiany w ekspresji genów. Ekspresja genów może być regulowana przez chemiczne modyfikacje RNA. Dotychczas opisano ponad 170 różnych modyfikacji kwasów nukleinowych. Wykazano, że modyfikacje transkryptów modulują ich stabilność, translokację i wydajność translacji.  Zaburzenia w maszynerii zaangażowanej w procesy metylacji/demetylacji RNA skutkowały poważnymi defektami rozwojowymi w roślinie modelowej – rzodkiewniku. Celem niniejszego projektu jest poznanie roli trzech dotychczas mniej poznanych modyfikacji RNA, 5-metylocytozyny (m5C), 1-metyloadenozyny (m1A) i 8-nitorguanozyny (8-NO2-G),  w odpowiedzi siewek soi na działanie metali. Planowane badania obejmą wykrycie modyfikowanych nukleotydów w tkankach roślinnych, zmierzenie zmian w ich poziomie w odpowiedzi na działanie kadmu (Cd), miedzi (Cu) i ołowiu (Pb), zsekwencjonowanie transkryptów zawierających te modyfikacje oraz zbadanie ich wpływu na proces translacji. Wyniki uzyskane w ramach projektu pozwolą na pozyskanie kompleksowego obrazu zmian epitranksryptomicznych w odpowiedzi siewek soi na działanie metali. Zarówno uzyskane wyniki jak  i opracowana metodyka może posłużyć kolejnym badaniom dotyczącym roli modyfikacji RNA  w odpowiedzi roślin na warunki stresowe.

Opis projektu: https://projekty.ncn.gov.pl/index.php?projekt_id=616856